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2022年7月,Google DeepMind和欧洲分子生物学实验室的生物信息学研究所,公开了一次非常大的数据库更新。 AlphaFold数据库里的蛋白质三… · @lzd412476732 · TwKit

@lzd412476732

2022年7月,Google DeepMind和欧洲分子生物学实验室的生物信息学研究所,公开了一次非常大的数据库更新。 AlphaFold数据库里的蛋白质三维结构预测,从此前接近100万条扩展到超过2亿条。 蛋白质由氨基酸组成,但研究它在空间里如何折叠并不容易。 过去想得到一个可靠结构,经常要做复杂实验,耗费很多时间。 AlphaFold尝试根据序列预测三维形状,让研究人员先有个可供研究的模型。 这里有个容易误解的地方:2亿条预测不等于2亿个结构都已经被实验确认。 不同位置的预测可信度也有差别。 EMBL-EBI在2022年的公告里明确写了这些数据免费向科研界开放。 我觉得这个变化的规模很惊人。 以前研究一种蛋白质,先得为“它长什么样”花不少工夫,现在许多研究可以直接从公开预测结果往下走。

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